遼代，為上京道烏古迪烈統(tǒng)軍司所轄；金代，設(shè)置臨黃府路慶州大鹽樂群牧司。
元代，屬嶺北行省濟(jì)南王部管轄地。
清初，設(shè)烏珠穆沁左旗。
1949年，歸東部聯(lián)合旗。
1956年，東烏珠穆沁旗建制。
1956年，原東部聯(lián)合旗的第五、第六、第七佐（后改為5個(gè)蘇木），25個(gè)巴嘎劃歸東烏珠穆沁旗。
西烏珠穆沁旗的道特淖爾、寶拉格、敦達(dá)高畢、呼布?xì)J高畢、薩麥、阿拉坦合力、額和寶拉格劃歸東烏珠穆沁旗。
1975年，烏拉蓋公社、呼熱圖淖爾公社、寶格達(dá)山林場劃歸東烏珠穆沁旗。
1983年，烏尼特牧場劃歸東烏珠穆沁旗。
1984年1月，巴音胡碩鎮(zhèn)歸東烏珠穆沁旗，8月，滿都呼寶拉格牧場劃歸東烏珠穆沁旗。