公元1世紀，悉補野部落第七代贊普止貢之子夏赤在工布建立小邦國，成為工噶布王（即工布王），統(tǒng)治包括米林在內(nèi)的工布地區(qū)。
7世紀，吐蕃政權建立后，松贊干布把吐蕃地區(qū)的軍事組織為主的行政地區(qū)劃分成五大翼，即：衛(wèi)茹、約茹、葉茹、茹拉、蘇毗茹，今米林縣屬于約茹管轄。
7世紀至9世紀，吐蕃政權時期，工布王劃地稱王，其轄區(qū)享有相對獨立性。
唐咸通十年（869年，藏歷土雞年），吐蕃發(fā)生奴隸平民起義。
起義首先從今米林縣與朗縣交界處爆發(fā)，起義軍推翻工噶布王的統(tǒng)治。
不久，吐蕃政權被推翻，西藏處于分散割據(jù)時期，工布地區(qū)未能形成統(tǒng)一的地方政權，每個地方由當?shù)氐馁F族頭領統(tǒng)治。
11世紀，工噶布王后裔阿杰在工布恰納（米林境內(nèi)羌納村）一帶崛起，成為工布地區(qū)統(tǒng)治者，米林亦屬于工布阿杰王的統(tǒng)轄區(qū)。
13世紀至14世紀中葉，元朝在西藏設烏思藏納里速古魯孫等三路宣慰使司都元帥府，米林縣境大部分屬其轄區(qū)。
14世紀50年代，帕木竹巴政權時期，明朝設烏思藏行都指揮使司，米林縣大部分屬其轄區(qū)。
明崇禎十五年（1642年，藏歷第十一饒迥水馬年），甘丹頗章政權派兵征服工布。
清康熙二年（1663年，藏歷第十一繞迥水兔年）新建則拉崗宗。
則拉崗宗轄16個“第巴”（“第巴”是民主改前西藏宗的基層行政機構，相當于鄉(xiāng)，既是官名又是行政區(qū)劃單位名稱）。
1921年（藏歷第十五饒迥鐵雞年），民國政府設川邊特別行政區(qū)，今米林縣屬川邊特別行政區(qū)管轄。
1939年（藏歷第十六饒迥鐵豬年），西康省正式建立，在江達設太昭局，米林縣納入其行政區(qū)劃，由于當時全國處于抗戰(zhàn)階段，西康省對金沙江以西的縣并沒有實行有效管轄。
1951年6月，波密分工委在昌都組建，7月，正式成立波密分工委。
則拉崗宗隸屬其管轄。
1954年，則拉崗宗屬塔工基巧。
1959年8月，將原則拉崗宗所轄的甲拉、大渡卡、結果、羌納、派多、庫加、臥龍、嘎加、江中、登米、勝布、康沙、扎西繞登13個地方合并，設置米林縣，屬塔工專區(qū)管轄。
1960年1月，經(jīng)國務院批準，撤銷則拉崗宗（不含該宗東北部的嘎瑪、俄當2個地方），設置米林縣，隸屬林芝專區(qū)。
1960年2月，塔工專區(qū)公署更名為林芝專區(qū)公署，米林縣歸其管轄。
1964年7月，經(jīng)國務院正式批準，林芝專區(qū)撤銷，米林縣劃歸拉薩市管轄。
1983年10月，經(jīng)國務院批準，恢復林芝地區(qū)行政公署，米林縣歸林芝地區(qū)管轄。
1986年2月，米林縣正式復歸林芝地區(qū)管轄。
2015年3月，國務院批準撤銷林芝地區(qū)，設立地級林芝市，米林縣屬林芝市管轄。